Opgericht met als naam Racing Club Péruwelz, welke na verloop van tijd het voorvoegsel Royal krijgt.

In 2010 volgt er een officieuze fusie met het failliete Excelsior Mouscron.

Een naamswijziging volgt in 2012 naar Royal Mouscron-Péruwelz.

In 2016 volgt er een volgende naamswijziging naar Royal Excel Mouscron.

In 2022 verwerft de club geen proflicentie voor het seizoen 2022-2023, waarna het faillissement wordt aangevraagd.